{"id":39966,"date":"2025-09-16T01:07:02","date_gmt":"2025-09-15T23:07:02","guid":{"rendered":"https:\/\/huberpower.com\/wordpress\/?p=39966"},"modified":"2025-10-02T09:38:56","modified_gmt":"2025-10-02T07:38:56","slug":"populationsstruktur-der-aesche-im-salzkammergut","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/huberpower.com\/wordpress\/?p=39966","title":{"rendered":"POPULATIONSSTRUKTUR DER \u00c4SCHE IM SALZKAMMERGUT 2024-2025"},"content":{"rendered":"\n

Wir haben weitere DNA-Proben von \u00c4schen gesammelt und diese einer neuerliche „Bewertung der nat\u00fcrlichen und gest\u00f6rten Populationsstruktur der \u00c4sche (Thymallus thymallus) im Salzkammergut“<\/mark><\/strong> in Auftrag gegeben um mit einer kombinierte phylogeographische (mitochondriale DNA) und populationsgenetische (Mikrosatelliten) Daten zur Struktur unserer \u00c4schen-Populationen zu erhalten<\/mark>. Die Studie stellte fest , dass es in Populationen s\u00fcdlich der Alpen zu einer umfassenden Genvermischung (Introgression) durch den Menschen kam, w\u00e4hrend n\u00f6rdlich der Alpen weniger St\u00f6rungen auftraten.<\/mark><\/strong> <\/p>\n\n\n\n

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Hintergrund<\/h2>\n\n\n\n

Im Jahr 2020\/2021 haben wir insgesamt 28 Proben von \u00c4schen aus dem oberen Salzkammergut, darunter war auch Material aus einer Fischzuchtanlagen dabei und haben diese genetisch untersuchen lassen und diese wurden mit verschiedenen Referenzproben aus dem Archiv der Uni-Graz verglichen. Die Ergebnisse dieser Untersuchung aus dem Jahr 2020\/2021 haben gezeigt, dass mindestens 10 der 28 Proben, offenbar Abstammungslinien repr\u00e4sentieren, die eindeutig nicht aus der Region stammen. <\/mark><\/strong><\/p>\n\n\n\n\n\n

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Folgestudie 2024\/2025<\/h2>\n\n\n\n

In dieser Folgestudie 2024\/2025 werden jetzt 49 neue Proben untersucht, <\/mark><\/strong>die an verschiedenen Stellen des Traun-Flusssystems im oberen Salzkammergut gesammelt wurden. Diese werden wieder mit Referenzlinien und den Proben aus der vorherigen Studie von 2020\/2021 verglichen. <\/p>\n\n\n\n

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Tabelle 1. Liste der \u00c4schen Populationen in dieser Studie. Angegeben sind die in diesem Bericht verwendeten Probenk\u00fcrzel, die Herkunft der Proben sowie die Anzahl der Individuen, die untersucht wurden.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Methodik<\/h2>\n\n\n\n

Genau wie bei unserer Analyse von 2020\/2021, wurden auch mit der neuen Proben-Sammlung 2024 zwei genetische Methoden bei den Proben angewendet. <\/p>\n\n\n\n

mtDNA-Analyse<\/h3>\n\n\n\n

Als Erstes, wurden die sogenannte Kontrollregion der mtDNA-Molek\u00fcle<\/mark><\/strong> sequenziert und in einem zweiten Schritt, die 11 Mikrosatelliten-Loci amplifiziert und auf Allel-Variabilit\u00e4t<\/mark><\/strong> untersucht. Die mtDNA-Sequenzen helfen dabei, Haplotypen den Hauptlinien zuzuordnen, die schon in mehreren Publikationen Instituts der UNI-Graz aus ganz Europa beschrieben wurden. Dieser Ansatz funktioniert zwar sehr gut, um fremde Abstammungslinien zu erkennen, aber er kann weder die Herkunft einzelner Fische belegen, noch einzelne Fische identifizieren, die gekreuzt wurden. Das liegt daran, dass mtDNA<\/mark><\/strong> nur \u00fcber die m\u00fctterliche Linie vererbt wird und dass ein Haplotyp, sobald er in eine Population gelangt ist, viele Generationen lang bestehen bleiben kann, auch wenn kein weiteres Fremdmaterial hinzukommt. <\/p>\n\n\n\n

Mikrosatelliten-Analyse <\/h3>\n\n\n\n

Deshalb wird die mtDNA-Analyse mit einer Analyse mittels Mikrosatelliten<\/mark><\/strong> verbunden, welche eine h\u00f6here Aufl\u00f6sung aufweist. Mikrosatelliten werden von beiden Elternteilen vererbt und haben eine h\u00f6here Mutationsrate als mtDNA.<\/mark><\/strong> Dadurch kann man zwischen nah verwandten Populationen bzw. Individuen unterscheiden. Sie liefern Informationen dar\u00fcber, wie eng die Individuen miteinander verwandt sind und ob ein einzelner Fisch eine Mischung aus mehreren St\u00e4mmen ist oder nicht.<\/p>\n\n\n\n


mtDNA-Stammbaum <\/h2>\n\n\n\n

Die Kontroll-Region der mtDNA von 43 Proben wurde erfolgreich sequenziert und wie auch in der fr\u00fcheren Studie, ein Stammbaum mit Referenzproben aus ganz Europa erstellt.<\/p>\n\n\n\n

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Abbildung 1. Stammbaum berechnet aus den Proben vom Salzkammergut (2020 & 2024) und \u00fcber 110 Referenzen aus ganz Europa. Die Sequenzen aus dem Salzkammergut sind farblich markiert und die Zuordnung zu den einzelnen Hauptlinien in Tabelle 2 zusammengefasst. Einige einzelne Haplotypen aus gr\u00f6\u00dferen Gruppen, wie zum Beispiel der n\u00f6rdlichen Donau-Gruppe, sind zusammengefasst und nicht im Stammbaum dargestellt (Siehe Tab. 2).<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n
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Tabelle 2. Liste aller gelieferten Proben, einschlie\u00dflich einer individuellen ID-Nummer, dem Ort, wo die Probe genommen wurden, der Anzahl der erfolgreich typisierten Mikrosatelliten-Loci und einer Zuordnung zu einer Hauptlinie basierend auf der mtDNA-Sequenzierung.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

77% einheimischen Linie = Salzkammergut \u00c4sche<\/h3>\n\n\n\n

Die mtDNA von 33 (77 %) der sequenzierten Individuen, konnte der f\u00fcr die n\u00f6rdliche Alpenregion typischen einheimischen Linie zugeordnet werden.<\/mark><\/strong> F\u00fcnf weitere mtDNA-Sequenzen wurden der sogenannten Rhein\/Donau- oder der Mitteleuropa gemischt-Linie zugeordnet, die in der Region auch ziemlich h\u00e4ufig vorkommt. <\/p>\n\n\n\n

Die restlichen sechs mtDNA-Sequenzen wurden entweder einer Donau-Slowenien-Linie oder der Adria-Linie zugeordnet und stammen aus Fischbesatzma\u00dfnahmen aus der Aktion „Rettet die \u00c4sche“, die \u00fcber viele Jahre durchgef\u00fchrt wurde und 2019 beendet wurde.<\/p>\n\n\n\n

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\u00dcber viele Jahre wurden \u00c4schen unbekannter Herkunft besetzt und wie man sieht, haben sich einige davon in den „Salzkammergut-Stamm“ integriert. Seit 2020 werden nur noch \u00c4schen, die aus der Oberen Traun stammen \u00fcber das Revier-Bruthaus entwickelt und per Cocooning \u00fcber die Obere Traun, je nach Verf\u00fcgbarkeit verteilt und ausgesetzt. <\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Mikrosatelliten Loci Traun \u00c4schen<\/h2>\n\n\n\n

Mikrosatelliten-Loci sind bestimmte Orte im Genom, die repetitive DNA-Sequenzen wie kurze Tandem-Wiederholungen (STRs) aufweisen, deren Anzahl zwischen Individuen variiert<\/mark>.<\/p>\n\n\n\n

Die Anzahl der erfolgreich amplifizierten Mikrosatelliten-Loci<\/mark><\/strong> war bei den einzelnen Proben unterschiedlich (siehe Tabelle 2). Die Proben, die nicht in die Analyse einbezogen wurden, sind rot markiert (N = 5, Tabelle 2). Die genetische Beziehung zwischen den einzelnen Proben wird mit Hilfe einer faktoriellen Korrespondenzanalyse dargestellt. Die zu untersuchenden Individuen wurden zusammen mit den sechs Referenzpopulationen, sowie den Proben von 2020 (Tabelle 1) untersucht und die Ergebnisse in Abbildung 2 dargestellt. <\/p>\n\n\n\n

Die Grafik zeigt nur die ersten beiden Hauptachsen der Analyse und macht so die gr\u00f6\u00dften Unterschiede zwischen den Populationen deutlich, aber nicht unbedingt alle kleinen Unterschiede (daf\u00fcr k\u00f6nnte man noch weitere Achsen nehmen). Achse 1, trennt nordalpine Individuen, welche auf der rechten Seite der Abbildung zu sehen sind,<\/mark><\/strong> von allen anderen. Achse 2, trennt wiederum die Linie der Donau, s\u00fcdlich der Alpen (rot, ODR), von den anderen Linien.<\/p>\n\n\n\n

Die meisten der Proben aus dem Salzkammergut (2024) liegen in der Gruppe der n\u00f6rdlichen Donaulinie (rechts Mitte).<\/strong> Ein Individuum, f\u00e4llt allerdings nicht mit diesen und eher mit einer bestimmten Gruppe zusammen, was in der unteren Mitte des Diagramms zu sehen ist. Im Vergleich traf, dies 2020 auf sechs Proben zu.<\/p>\n\n\n\n

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Abbildung 1. Grafische Darstellung (FCA) der Proben aus dem Salzkammergut inklusive aller Referenzpopulation.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Auswertung mit Structure<\/h2>\n\n\n\n

Das Programm \u201e<\/em>Structure<\/mark><\/strong>\u201c<\/em> ist ein Softwarepaket zur Analyse von Populationsstrukturen anhand von Multilocus-Genotypdaten<\/mark><\/strong>. Es erm\u00f6glicht die Erkennung unterschiedlicher Populationen, die Zuordnung von Individuen zu Populationen, die Untersuchung von Hybridzonen, die Identifizierung von Migranten und gemischten Individuen sowie die Sch\u00e4tzung von Population Allel-Frequenzen<\/mark><\/strong> in Situationen, in denen viele Individuen Migranten oder gemischte Individuen sind. <\/p>\n\n\n\n

Um ein genaueres Verst\u00e4ndnis der genetischen Zusammensetzung einzelner Proben zu bekommen, haben wir die Daten noch einer weiteren Analyse, mit dem Programm STRUCTURE unterzogen. Diese Analyse liefert nicht nur eine h\u00f6here Aufl\u00f6sung als die ersten beiden Achsen der FCA, sondern gibt auch Aufschluss \u00fcber den Grad der Vermischung innerhalb einzelner Proben.<\/mark><\/strong> Diese Analyse wurde in der vorhergehenden Studie 2020\/2021 nicht durchgef\u00fchrt.<\/p>\n\n\n\n

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Abbildung 3. Grafische Darstellung der STRUCTURE Analyze (K = 6).<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Zum Beispiel gibt’s an der Stelle \u201eIschler-Traun-Stadt\u201c haupts\u00e4chlich die Population in rosa,<\/strong><\/mark> w\u00e4hrend die Population in hellgr\u00fcn eher an der Stelle \u201eIschler-Traun\u201c<\/mark><\/strong> zu finden ist. Die hellblaue Populationsgruppe kommt im gesamten System vor und k\u00f6nnte daher (spekulativ) eher die einheimische Population repr\u00e4sentieren.<\/strong><\/mark><\/p>\n\n\n\n

Diese Analyse zeigt sechs genetische Gruppen, welche unterschiedlich farblich markiert sind. <\/p>\n\n\n\n